MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84c

Total Repeats: 6796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011987	CGC	2	6	314664	314669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102261
5502	NC_011987	TGC	2	6	314763	314768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102261
5503	NC_011987	CGG	2	6	314769	314774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102261
5504	NC_011987	CTTC	2	8	314827	314834	0 %	50 %	0 %	50 %	222102261
5505	NC_011987	TCT	2	6	314953	314958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102262
5506	NC_011987	ACC	2	6	315054	315059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102262
5507	NC_011987	TCG	2	6	315081	315086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102262
5508	NC_011987	GCG	3	9	315337	315345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102263
5509	NC_011987	CAC	2	6	315349	315354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102263
5510	NC_011987	GCA	3	9	315359	315367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102263
5511	NC_011987	GAT	2	6	315370	315375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102263
5512	NC_011987	TGC	2	6	315390	315395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102263
5513	NC_011987	TCA	2	6	315447	315452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102263
5514	NC_011987	GAC	2	6	315466	315471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102263
5515	NC_011987	CTT	2	6	315478	315483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102263
5516	NC_011987	CAG	2	6	315493	315498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102263
5517	NC_011987	CTT	2	6	315514	315519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102263
5518	NC_011987	CAA	2	6	315556	315561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102263
5519	NC_011987	TCG	2	6	315587	315592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102263
5520	NC_011987	GCA	2	6	315595	315600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102263
5521	NC_011987	GCCT	2	8	315603	315610	0 %	25 %	25 %	50 %	222102263
5522	NC_011987	CAGG	2	8	315617	315624	25 %	0 %	50 %	25 %	222102263
5523	NC_011987	ACG	2	6	315711	315716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102263
5524	NC_011987	CGA	2	6	315777	315782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102263
5525	NC_011987	AAG	2	6	315845	315850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102263
5526	NC_011987	GAA	2	6	315869	315874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102263
5527	NC_011987	AAG	2	6	315965	315970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102263
5528	NC_011987	GAC	2	6	315974	315979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102263
5529	NC_011987	TGC	2	6	315987	315992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102263
5530	NC_011987	CG	3	6	316031	316036	0 %	0 %	50 %	50 %	222102263
5531	NC_011987	GAC	2	6	316040	316045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102263
5532	NC_011987	CGA	2	6	316080	316085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102263
5533	NC_011987	CT	3	6	316180	316185	0 %	50 %	0 %	50 %	222102263
5534	NC_011987	ACA	2	6	316221	316226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102263
5535	NC_011987	TCA	2	6	316227	316232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102263
5536	NC_011987	AATG	2	8	316370	316377	50 %	25 %	25 %	0 %	222102264
5537	NC_011987	CTT	2	6	316428	316433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102264
5538	NC_011987	TTC	2	6	316483	316488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102264
5539	NC_011987	CTG	2	6	316493	316498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102264
5540	NC_011987	GCC	2	6	316530	316535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102264
5541	NC_011987	CTT	2	6	316571	316576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102264
5542	NC_011987	GC	3	6	316583	316588	0 %	0 %	50 %	50 %	222102264
5543	NC_011987	TTC	2	6	316622	316627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102264
5544	NC_011987	CTAT	2	8	316672	316679	25 %	50 %	0 %	25 %	222102264
5545	NC_011987	TTCG	2	8	316767	316774	0 %	50 %	25 %	25 %	222102264
5546	NC_011987	AC	3	6	316798	316803	50 %	0 %	0 %	50 %	222102264
5547	NC_011987	TGC	2	6	316810	316815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102264
5548	NC_011987	GCC	2	6	316854	316859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102264
5549	NC_011987	CTC	2	6	316920	316925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102264
5550	NC_011987	CTGG	2	8	316926	316933	0 %	25 %	50 %	25 %	222102264
5551	NC_011987	CTGT	2	8	316959	316966	0 %	50 %	25 %	25 %	222102264
5552	NC_011987	TG	3	6	316969	316974	0 %	50 %	50 %	0 %	222102264
5553	NC_011987	GTG	2	6	316983	316988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102264
5554	NC_011987	CCT	2	6	317003	317008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102264
5555	NC_011987	GGC	2	6	317045	317050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102264
5556	NC_011987	TGC	2	6	317057	317062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102264
5557	NC_011987	GGC	2	6	317088	317093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102264
5558	NC_011987	TC	3	6	317145	317150	0 %	50 %	0 %	50 %	222102264
5559	NC_011987	GCT	2	6	317168	317173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102264
5560	NC_011987	AGC	2	6	317258	317263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102264
5561	NC_011987	CGCT	2	8	317265	317272	0 %	25 %	25 %	50 %	222102264
5562	NC_011987	TGA	2	6	317341	317346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102264
5563	NC_011987	ACG	2	6	317439	317444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102264
5564	NC_011987	TGA	2	6	317562	317567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102264
5565	NC_011987	GGC	3	9	317595	317603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102265
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5567	NC_011987	TGC	2	6	317694	317699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102265
5568	NC_011987	CGC	2	6	317713	317718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102265
5569	NC_011987	CGC	2	6	317782	317787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102265
5570	NC_011987	ATT	2	6	317801	317806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102265
5571	NC_011987	CCGC	2	8	317819	317826	0 %	0 %	25 %	75 %	222102265
5572	NC_011987	GGC	2	6	317835	317840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102265
5573	NC_011987	TGC	2	6	317868	317873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102265
5574	NC_011987	TGT	2	6	317929	317934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102265
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5580	NC_011987	CGAG	2	8	318201	318208	25 %	0 %	50 %	25 %	222102265
5581	NC_011987	GC	3	6	318229	318234	0 %	0 %	50 %	50 %	222102265
5582	NC_011987	GCC	2	6	318323	318328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102265
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5587	NC_011987	TGGCT	2	10	318512	318521	0 %	40 %	40 %	20 %	222102265
5588	NC_011987	TCG	2	6	318573	318578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102265
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5591	NC_011987	CGG	2	6	319143	319148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102266
5592	NC_011987	CGG	2	6	319209	319214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102266
5593	NC_011987	TGCC	2	8	319368	319375	0 %	25 %	25 %	50 %	222102266
5594	NC_011987	CGG	2	6	319485	319490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102266
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5598	NC_011987	AT	3	6	319574	319579	50 %	50 %	0 %	0 %	222102266
5599	NC_011987	CCA	2	6	319625	319630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102266
5600	NC_011987	CAGG	2	8	319635	319642	25 %	0 %	50 %	25 %	222102266
5601	NC_011987	CGA	2	6	319647	319652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102266
5602	NC_011987	AAG	2	6	319676	319681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102266
5603	NC_011987	AAGG	2	8	320124	320131	50 %	0 %	50 %	0 %	222102267
5604	NC_011987	GCT	2	6	320142	320147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102267
5605	NC_011987	TCG	2	6	320223	320228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102267
5606	NC_011987	CGA	2	6	320338	320343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102267
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5608	NC_011987	CGT	2	6	320527	320532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102267
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5611	NC_011987	GGA	2	6	320650	320655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102267
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5621	NC_011987	GC	3	6	320999	321004	0 %	0 %	50 %	50 %	222102267
5622	NC_011987	CGC	2	6	321013	321018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102267
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5742	NC_011987	GC	3	6	326552	326557	0 %	0 %	50 %	50 %	222102272
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5744	NC_011987	CGA	3	9	326626	326634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102272
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5985	NC_011987	AGA	2	6	338716	338721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102281
5986	NC_011987	CAA	2	6	338727	338732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102281
5987	NC_011987	GAT	2	6	338852	338857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102282
5988	NC_011987	TCA	2	6	338978	338983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102282
5989	NC_011987	GTT	2	6	339018	339023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102282
5990	NC_011987	CGA	2	6	339050	339055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102282
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5993	NC_011987	CTCAT	2	10	339108	339117	20 %	40 %	0 %	40 %	222102282
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5997	NC_011987	TGC	2	6	339244	339249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102282
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5999	NC_011987	TCT	2	6	339305	339310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102282
6000	NC_011987	CGC	2	6	339335	339340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102282

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